Là một trong những đơn vị giảng dạy và nghiên cứu khoa học lớn có uy tín của Trường đại học Tôn Đức Thắng, Khoa quản trị kinh doanh được tách ra từ Khoa kinh tế ngày 15/03/2006. Trước đó, Khoa kinh tế với gần 9 năm thành lập là Khoa lớn nhất trường về mọi mặt. Khoa kinh tế từng là nơi sáng tạo ra những chương trình, hoạt động lớn và có uy tín cho trường, như: Chương trình đào tạo gắn với doanh nghiệp, Diễn đàn doanh nghiệp, Chương trình kiến tập sinh viên, Câu lạc bộ các nhà doanh nghiệp trẻ, Trung tâm hướng nghiệp sinh viên và việc làm, Nội san khoa học và ứng dụng, Lớp quản trị kinh doanh quốc tế học bằng tiếng...